現在，世界では50の細菌の「門」が知られているが，そのうち8から12の門はヒトの体外に見つかる。そのうちの99.9パーセントを占めるのが，バクテロイデス門とフィルミクテス門を含む6つの門である。最も成功した（つまりヒトと暮らすという意味において）細菌が，ヒト・マイクロバイオームの核心を構成する。時間とともに，彼らはヒトの身体に常在し，そこで繁栄するための特性を獲得していった。そうした特性のなかには，酸性環境下でも生存できる，ヒトの食事から栄養を摂取できる，湿潤よりも乾燥を好む，あるいはその反対といったものがある。
すべての細菌を合わせると，一人あたり約三ポンド，つまり脳に匹敵する重量の細菌がヒトに常在し，その種は一万に及ぶ。1000種以上の動物を有する動物園はアメリカにはない。ヒトの身体の内外に棲む目に見えない「細菌動物園」は，より多様で複雑である。
マーティン・J・ブレイザー 山本太郎（訳） (2015). 失われてゆく，我々の内なる細菌 みすず書房 pp. 28-29
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